الف) کتابها:
۱. الهیات فلسفی: (دروس الهیات بالمعنی الأخص منظومهی حکـیم سبزواری)(منتشر نشده).
۲٫ تقریرات بخشی از دروس فقه جهاد آیتالله سیدعلی خامنهای؛ (منتشر نشده).
۳٫ تقریرات دروس اصول فقه (مبحث الفاظ) آیتالله وحید خراسانی؛ (منتشر نشده).
۴٫ تقریرات دروس فقه (صلوهًْ، ولایت فقیه، بخشی از مکاسب محرمه، ربا، خمس) آیتالله مجتبی تهرانی؛ (منتشر نشده)
۵٫ تقریرات دروس فقه آیتالله حسینعلی منتظری؛ (منتشر نشده).
۶٫ تقریرات دورهی کامل دروس اصول فقه آیتالله مجتبی تهرانی؛ (منتشر نشده).
۷٫ تلویحات (سرودههای استاد دربارهی امام خمینی)؛ مؤسسهی تنظیم و نشر آثار امام خمینی(ره)؛ ۱۳۸۸ ش.
۸٫ تماشای جمال(دیوان اشعار استاد)؛ مؤسسه انتشاراتی اطلاعات؛ چاپ اول: ۱۳۷۲ / چاپ سوم ۱۳۸۶٫
۹٫ حریت و مدارات (اندیشه سیاسی)؛ مؤسسهی امیرکبیر؛ چاپ اول: بهار ۱۳۸۶/ چاپ دوم ۱۳۹۰
۱۰٫ حــوزه؛ سه نگاه (مجموعهی سخنرانیها و گفتوگوها / منتشر نشده)
۱۱٫ خشونت و مـدارا؛ کانون اندیشهی جوان؛ چاپ اول: پاییز ۱۳۷۹ / چاپ دوم ۱۳۸۷٫
۱۲٫ دانشنـامهی امام علی ع (سیزده جلد)؛ سرپرستی و ویراستاری علمی؛ پژوهشگاه فرهنگ و اندیشهی اسلامی؛ چاپ اول: ۱۳۸۰ش/ ۲۰۰۱ م. چاپ چهارم: ۱۳۸۷ ش/ ۲۰۰۸ م.
۱۳٫ دانشنامــهی فرهنگ فاطمی(س)؛ سرپرستی و ویراستاری علمی؛ پژوهشگاه (در شرف چاپ)
۱۴٫ دانشنامــهی قرآنشناسی؛ سرپرستی و ویراستاری علمی؛ (در دست تالیف)
۱۵٫ دروس فلسفه¬ی اصول؛ پژوهشگاه فرهنگ و اندیشهی اسلامی؛ (در شرف چاپ)
۱۶٫ دموکراسی قدسی: (اندیشه و فلسفهی سیاسی)؛ پژوهشگاه فرهنگ و اندیشه اسلامی؛ چاپ اول: بهار ۱۳۷۹/ چاپ دوم ۱۳۸۲٫
۱۷٫ دینپژوهی معاصر (ارزیابی گفتمانهای دینی سهگانه ایران)؛ پژوهشگاه فرهنگ و اندیشهی اسلامی؛ چاپ اول: ۱۳۸۳ش/ چاپ سوم ۱۳۸۸٫
۱۸٫ دیوان امام خمینی (نسخهی اول)؛ سرپرستی تدوین و تهیهی ملحقات؛ مؤسسهی تنظیم و نشر آثار امام خمینی(ره)؛ چاپ اول: خرداد ۱۳۷۲/ چاپهای مکرر.
۱۹٫ دیوان امام خمینی (نسخهی دوم)؛ مقدمه، اضافات و تعلیقات؛ مؤسسهی چاپ و نشر عروج؛ بهار ۱۳۷۷ ش/ ۱۹۹۸ م.
۲۰٫ ساقههای سبز قنوت (شعر نماز و نیایش)؛ مؤسسهی اطلاعات؛ چاپ اول: ۱۳۷۴ ش/ ۱۹۹۵ م.
۲۱٫ سنن حاکم بر تاریخ از منظـر قرآن؛ تهران؛ چاپ اول: ۱۳۶۵ش/ ۱۹۸۶ م.
۲۲٫ سوگنــامـهی ۱؛ سرپرستی گزینش و تدوین؛ مؤسسهی تنظیم و نشر آثار امام خمینی(ره)؛ چاپ اول: بهار ۱۳۶۹ ش/۱۹۹۰ م.
۲۳٫ شریعـهی خرد (تدوین با همکاری دیگران)؛ پژوهشگاه فرهنگ و اندیشهی اسلامی؛ چاپ اول، تابستان ۱۳۷۶ ش/ ۱۹۹۷ م.
۲۴٫ شور اشراق (مجموعهی مقالات در زمینهی شعر و ادب)؛ حوزهی هنری؛ چاپ اول: ۱۳۷۶ ش/۱۹۹۷ م.
۲۵٫ شهود و شیدایی: (تأملاتی در باب هنر)؛ مؤسسهی اطلاعات؛ چاپ اول: ۱۳۷۵ ش/ ۱۹۹۶ م.
۲۶٫ علمالنفس، جلد هشتم اسفار صدرالمتألهین محمد شیرازی؛ تحقیق، تصحیح انتقادی و مقدمه؛ بنیاد حکمت اسلامی صدرا؛ چاپ اول: ۱۳۸۲ ش / ۲۰۰۳ م.
۲۷٫ فلسفه¬ی اصول (ج۱)؛ تصنیف؛ پژوهشگاه فرهنگ و اندیشهی اسلامی؛ (در شرف چاپ).
۲۸٫ فلسفهی دین؛ پژوهشگاه فرهنگ و اندیشهی اسلامی؛ چاپ اول: ۱۳۸۳ ش/ ۲۰۰۴ م/ چاپ دوم ۸۵٫
۲۹٫ گزیدهی اشعار؛ نیستان؛ چاپ اول: ۱۳۷۹ ش/ ۱۹۹۸ م.
۳۰٫ گزیدهی غزلهای حکیم فیاض لاهیجی؛ گزینش، تصحیح و مقدمه؛ مؤسسهی امیرکبیر؛ چاپ اول: تابستان ۱۳۷۲ ش/ ۱۹۹۳ م.
۳۱٫ مباحثه با جان هیک؛ سازمان انتشارات پژوهشگاه فرهنگ و اندیشهی اسلامی، چاپ اول، ۱۳۹۱
۳۲٫ معـراج سبـز: (چهل حدیث نماز)؛ گزینش و ترجمه؛ چاپ و نشر ستاد اقامهی نماز؛ تابستان ۱۳۷۲ش /۱۹۹۳ م و چاپ مکرر.
۳۳٫ معنا منهـای معنا؛ پژوهشگاه فرهنگ و اندیشهی اسلامی؛ چاپ اول: بهار ۱۳۸۸ ش/۲۰۰۹ م.
۳۴٫ منطق فهم دین: دیباچهوارهای بر روششناسی اکتشاف گزارهها و آموزههای دینی؛ تصنیف؛ پژوهشگاه فرهنگ و اندیشهی اسلامی؛ چاپ اول ۱۳۸۹٫
۳۵٫ میخانهی عشق (شرح غزل عرفانی «چشم بیمار» امام خمینی«س»)؛ تألیف؛ سازمان تبلیغات اسلامی؛ چاپ اول: ۱۳۶۸ ش/ ۱۹۹۰م.
۳۶٫ نظریهی ابتنا؛ تألیف؛ هیأت حمایت از کرسیهای نظریهپردازی؛ چاپ اول ۱۳۸۹٫
ب) نمونهی مقالات:
۱٫ آزادی اهانت!؛ زمانه؛ شمارههای ۴۱و۴۲
۲٫ آزادی؛ فصلنامه الهیات / دانشگاه آزاد؛ شماره یک زمستان۸۲
۳٫ اجتهادگرائی و قرائت پذیرانگاری دین؛ بینش سبز؛ شماره ۶ و۷ اردیبهشت و خرداد ۸۰
۴٫ اجتهادگرایی و قرائتپذیرانگاری؛ قبسات؛ ش ۴۹ پاییز ۸۷
۵٫ احیای دین و اصلاح دینداری؛ قبسات؛ شماره ۲۲ زمستان ۸۰
۶٫ اهداف و قواعد گفت و گوی دینی و تمدنی؛ ماهنامهی ارتباط فرهنگی؛ مهر ۸۵
۷٫ بررسی انتقادی مبادیپژوهی اصولیون؛کتاب نقد؛ (در دست چاپ)
۸٫ پلورالیزم دین و چالش معیار؛ مجله الوحده؛ ش ۲۷۳ شعبان ۱۴۲۵ ق. ۲۲/۹/۸۱
۹٫ تأثیر تصویر اسلامی انسان بر سامانه حیات سیاسی؛ نشریه گفتگو: الهدی؛ سال ۸۰
۱۰٫ حجبالنور؛ کتاب نقد؛ ش ۳۵
۱۱٫ دانشنامه امام علی ع و آرمانها؛ قبسات؛ شماره ۱۹ بهار ۸۰
۱۲٫ درآمدی تأسیسی بر فلسفهی اصول فقه؛فصلنامه ذهن؛ ش ۴۳ پاییز ۱۳۸۹
۱۳٫ دربارهی بنیاد نخبگان؛ نشریهی گفتگو؛ خرداد ماه ۸۴
۱۴٫ دیباچهای بر منطق فهم دین؛ قبسات؛ بهار ۸۲
۱۵٫ دین و دموکراسی؛ قبسات؛ شماره ۲۰ و ۲۱ پاییز و زمستان ۸۰
۱۶٫ روش تفسیری ملاصدرا به روش عقلی و سپس تأویلی نزدیک است؛ دو هفته نامهی رایحه؛ ش ۶۸ ۱۵ بهمن ۸۸
۱۷٫ سنتپژوهی؛ فقه و حقوق؛ ش ۳ زمستان ۸۳
۱۸٫ سیطره مجاز؛ کتاب نقد؛ ش ۴۷ شهریور ۸۸
۱۹٫ سیطرهی مجاز در ساحت هویت تاریخی؛ فصلنامۀ راهبرد فرهنگ؛ ش ۲ تابستان ۸۷
۲۰٫ ضرورت تأسیس فلسفهی دین منطق کشف دین و فلسفهی معرفت دینی؛ قبسات؛ ش ۳۸
۲۱٫ فرجام قدسی تاریخ؛ دیالوگ؛ ش ۳ ـ ۲۰۰۵
۲۲٫ فرجام قدسی تاریخ؛ قبسات؛ ش ۳۳ پاییز ۸۳
۲۳٫ فرهنگپژوهی مقدم بر مهندسی فرهنگی؛ نشریه مهندسی فرهنگی؛ ۲۱ دیماه ۸۵
۲۴٫ فطرت به مثابه دال دینی؛ قبسات؛ ش ۳۶
۲۵٫ فقه و چالشها کاستیها و بایستگیهای آن؛کتاب نقد؛ ش ۳۳ زمستان ۸۳
۲۶٫ فلسفهی مضاف؛ قبسات؛ ش۳۹ و ۴۰ بهار و تابستان ۸۵
۲۷٫ فلسفه نو صدرائی؛ الفارابی؛ ش ۳ خرداد ۸۳
۲۸٫ فلسفهی معرفت دینی؛ فصلنامهی ذهن؛ ش ۴۰ زمستان ۱۳۸۸
۲۹٫ فلسفۀ فرج؛ کتاب نقد؛ شماره ۴ زمستان ۸۱
۳۰٫ قرائت پذیری؛ معرفت؛ آذر ۸۰
۳۱٫ گسترهی کارکرد و کاربرد عقل در تفهم و تحقق دین؛ فقه و حقوق؛ ش ۸
۳۲٫ گسترۀ کارکرد و کاربرد عقل در تفهم و تحقق دین؛ الحکمه؛ ش یک زمستان ۸۶
۳۳٫ گفتمان متجدد دستآوردها آسیبها و چالشها؛ زمانه؛ شماره ۹ خرداد ۸۲
۳۴٫ مباحثه با جان هیک؛ قبسات؛ ش ۳۶ پاییز ۸۴
۳۵٫ مبادی دخیل در تکون و تطور معرفت دینی؛فصلنامهی قبسات؛ ش ۵۲/ سال چهاردهم
۳۶٫ مرز بین پرسش و شبهه؛ پرسمان؛ پیش شماره ۳ ۲۱/۸/۸۰
۳۷٫ معنا منهای معنا؛ کتاب نقد؛ ش ۴۶ بهار ۸۷
۳۸٫ معیار علم دینی؛ ذهن؛ ش ۳۳
۳۹٫ منزلت و موانع عدالت؛ الهدی؛ ش ۸۴
۴۰٫ منزلت و موانع عدالت؛ دیالوگ؛ ش ۲ زمستان ۸۳
۴۱٫ موانع نقد و نوآوری در حوزۀ دین پژوهی؛ کتاب نقد؛ شماره ۲۷ و ۲۶ بهار ۸۲
۴۲٫ موانع نواندیشی در دینپژوهی؛ مشکوهًْ؛ تابستان ۸۳
۴۳٫ موانع نواندیشی دینی؛ قبسات؛ ش ۳۴ زمستان ۸۳
۴۴٫ موانع نواندیشی و نظریهپردازی؛ نشریه مردمسالاری؛ ۲۶ و ۲۱/۷/۸۴
۴۵٫ موانع و مشکلات همزیستی فرهنگی؛ دیالوگ؛ ش ۱ تابستان ۸۳
۴۶٫ مولانا و تکثرگرایی دینی؛فصلنامه حکمت و فلسفه؛ سال اول ش اول
۴۷٫ نظریهی ابتناء؛فصلنامهی قبسات؛ ش ۵۲/ سال چهاردهم
۴۸٫ نظریهی ابتنای تکون معرفت دینی بر « تأثیر ـ تعامل» مبادی خمسه (تئوری اکتشاف دیالکتیک ـ دینامیکال دین)؛قبسات؛ ش ۵۲ و ۵۳ دیماه ۸۸
۴۹٫ نقد نظریهی استاد معرفت در باب بطن و تأویل قرآن؛ کتاب نقد؛ ش ۳۵
۵۰٫ نقش و سهم فکر و فرهنگ دینی در توسعه؛ نمایه پژوهش؛ شماره ۷۰۸